《东瀛游侠》的故事背景设定在福建海口镇，这是一个充满武术氛围的地方。林同善和陈亚珍两家人，因为都从事武术行业，平日里鲜少往来，甚至存在一定的矛盾和隔阂。然而，这种看似平静的生活，却因为一次意外的事件而被打破。某日，侵华倭寇绑架了陈亚珍的孩子小毛头，这一消息迅速传遍了整个小镇。恰好，一位名叫上地完雄的年轻武士路过此地，他看到这一幕后，毫不犹豫地挺身而出，试图解救被绑架的孩子。上地完雄的勇敢行为不仅赢得了人们的尊敬，也为小镇带来了希望。然而，命运弄人的是，上地完雄在解救小毛头的过程中，不幸被倭寇误解并刺伤，从而背负了杀人的罪名。这个冤屈让上地完雄陷入了困境，但他并没有放弃。在这个过程中，小毛头成为了他最坚定的支持者，他坚信上地完雄是无辜的。在南少林寺尚智大师的调解下，林家和陈家终于放下了过去的恩怨，共同面对当前的困境。此时，正值妈祖节，街道上洋溢着欢乐祥和的气氛。然而，这平静的外表下却隐藏着更大的危机。日本人川岛和矢村正在暗中策划，企图盗取妈祖像上价值连城的夜明珠。他们利用倭寇作为掩护，企图一举夺取夜明珠。面对即将到来的危机，上地完雄决定挺身而出，与倭寇展开殊死搏斗。在这场惊心动魄的战斗中，上地完雄凭借自己的武艺和智慧，逐渐揭开了川岛和矢村的真面目。原来，他们不仅是倭寇的头目，更是受雇于某个邪恶势力，企图利用夜明珠的力量来达到不可告人的目的。在一场紧张刺激、生死攸关的决战中，上地完雄终于找到了证明自己清白的证据。他凭借自己的勇气和智慧，成功洗清了冤屈。而川岛和矢村也在决战中受到了应有的惩罚，他们的阴谋也彻底破产。最终，在众人的努力下，夜明珠被安全保护起来，避免了落入邪恶势力手中。林同善和陈亚珍两家也重新找回了曾经的亲情和友谊。这部剧不仅展现了武术的魅力，更通过生动的故事情节，传递了正义与勇气的价值观。