《特赦1959》以开国大典之后的历史为背景，精彩地描绘了毛泽东主席在百忙之中开始关注在押的国民党战犯的情况。他审慎地制定了对战犯的总体政策：不审不判不杀，而是给予人道主义待遇，组织他们进行政治学习和劳动改造，等待合适的时机再酌情处理。在公安部的精心组织和安排下，全国各地纷纷成立了战犯管理所，其中北京功德林管理所以其规模最大，成为了众多国民党战犯的集中地。王英光，这位新上任的战犯管理所所长，怀着激动和紧张的心情，来到了公安部报到。他见到了许多曾经在战场上与他刀兵相见的国民党高级将领，其中包括耿直的国军中将军长陈瑞章、多疑善变的国防部保密局华北行动处中将处长的刘安国、故意捣蛋的国民党军少将师长叶立三、以及迷信偏执的国民党军中将兵团司令蔡守元等人。这些昔日的敌人，如今却成为了战犯管理所中的“学员”，他们有的满脑袋“忠孝节义”，在面对审判时选择了自杀、绝食、伺机逃跑；有的则是因为担心遭到报复而痛哭流涕，丑态百出；还有的在被俘后立刻开始讨好解放军官兵，立功心切；更有甚者，积极参与了策反工作和战场信息咨询工作。王英光与这些战犯们展开了一场惊心动魄的斗智斗勇，他用自己的智慧和勇气，试图改变这些人的命运。在王英光的努力下，这些曾经的国民党高级将领开始认识到党中央改造战争罪犯的良苦用心，军心逐渐稳定下来。随着时间的推移，这批战犯在王英光等功德林管教人员的带领下，开始主动学习马列主义原理，将毛泽东思想作为自己的行为准则。他们积极投身于学习改造的各个环节，努力改造自己的思想，寻求心灵的解脱。经过一段时间的学习和改造，1959年，首批战犯被特赦。与此同时，王英光也在这段经历中收获了爱情，他与功德林管理所的医疗人员梁冬芳走到了一起。这些被特赦的战犯们，在经历了人生的巨大转变后，重新回到了人间。他们曾经在战场上与共产党为敌，但最终却在心灵上被共产党彻底降服。这部剧不仅展现了历史的沧桑巨变，更深刻地揭示了人性在面对巨大压力时的复杂变化。