《花蕊纹身》的故事起始于歌舞伎家庭,吉野美智代(谷ナオミ 饰)自小便对《京鹿子娘道成寺》中的尾形珠三郎(花柳幻舟 饰)心生倾慕。这份迷恋贯穿了她的一生,引导她在江户时代的传统与古朴环境中成长。成为江户千代之人形师的续弦后,美智代独自承担起抚养女儿宇子的重任。婚后半年,丈夫不幸离世,她从此守身如玉,一手照料继女,一手传承丈夫的人形制作技艺。岁月流转,宇子出落成美丽大姑娘,母女俩的情感日益深厚。