《新爱神之影》的故事背景设定在一个充满神秘色彩的现代都市，这里的居民们并不知道自己身边潜伏着拥有超能力的爱神后裔。男主角神宫寺崇德，是拥有强大光明之力的爱神后裔，他拥有一双能够看透人心的眼睛，能够洞察他人的内心世界。而女主角织田美咲，则是一个普通的高中生，她的生活平淡而充实，直到一天，她在学校的屋顶上遭遇了一只神秘的黑猫，从此她的命运发生了翻天覆地的变化。黑猫的出现，预示着爱神后裔的降临，神宫寺崇德和织田美咲因此被卷入了一场关于爱情和和平的冒险。
