《看不见的恋人》的故事背景设定在日本的江户时代,这是一个政治动荡、社会变革的时代。在这个时代背景下,两个家族——吉岡家和奥田家的命运交织在一起,形成了本剧的主要情节。吉岡龟藏,一个美丽聪慧的女性,是吉岡家的千金;而奥田修二,则是奥田家的骄傲,一个英俊潇洒的青年。两人的相遇,仿佛是命运的安排,从此他们的命运紧紧相连。