《超时空男臣(国)》的故事背景设定在明朝万历年间,东宫太子朱常洛与大太监张诚在朝廷中的权力斗争中互相对衡。张诚因为对钦天监预言的愤怒,决定采取极端手段,刺杀太子的未过门妻子郭倩。然而,在执行过程中,张诚意外地引发了一场混乱,导致众人逃入附近的一个神秘雾林。在雾林中,他们遭遇东厂伏兵的偷袭,众人被迫遁入雾林躲避。张诚为了逼迫他们现身,下令放火烧林,却不慎导致郭倩在混乱中走失。此时,东宫都尉袁崇焕和侍郎左光斗奉命护送郭倩进京,却同样被卷入这场时空混乱。