《极上生徒会》的故事背景设定在私立宫神学园，这是一所以学生为中心的私立高中。在这所学校里，存在一个权力凌驾于教职员之上的学生会组织，名为极上生徒会。这个组织不仅负责学校的日常运营，还要解决校园内发生的各种大小麻烦。故事的主人公兰堂梨乃，是一位刚刚转学而来的转校生，她在一次偶然的机会中被选为极上生徒会的书记。在这个以学生为中心的舞台上，兰堂梨乃将与她的伙伴们一起，共同面对挑战，维护学校的秩序，揭开隐藏在校园深处的秘密。
