《天师下山，要相信科学》的故事背景设定在一个充满神秘色彩的古装世界，主角林正英饰演的至尊天师，在继任后仍对尘世留有牵挂。他决定暂时放下天师的重任，下山一趟，以守护心爱之人，揭开当年悲剧的真相，并亲手为往昔的仇敌复仇。在这场充满未知与挑战的旅程中，林正英不仅要面对外界的敌人，还要应对内心的挣扎。他的智慧与勇气将在这场冒险中得到充分的展现。
