《异形大战忍者》的故事发生在一个充满阴谋和战争的日本战国时期。在这个动荡的时代，分属不同大名的忍者集团暗中较劲，而一个神秘的火球事件成为了整个故事的导火索。耶麻汰、阵内、老鼠等忍者，在执行一项刺探任务时意外与敌对势力发生了碰撞。就在这时，一个巨大的火球从天而降，给所有人带来了意想不到的影响。回到村中后，耶麻汰等人在首领的安排下，决定去森林中探查火球的真相。然而，他们却意外地邂逅了同属一派的凛林及其同伴。出于对未知的恐惧和对力量的渴望，众人决定结伴同行。但很快，他们就发现了一个更加危险的秘密——伊贺村落正遭受来自外星的异形的肆虐。这些异形不仅敏捷迅速，而且杀伤力巨大，让忍者们陷入了前所未有的恐慌。耶麻汰、阵内、凛林等人虽然侥幸逃过一劫，但他们的心中却充满了愤怒和疑惑。他们开始意识到，这个火球事件背后隐藏着一个更加庞大的阴谋。为了揭开真相，耶麻汰等人决定深入森林，寻找异形的踪迹。但他们很快发现，这片密林中还隐藏着更多的危险。不时有不明生物从四面八方袭来，让他们的行动变得更加艰难。然而，正是这些困难和挑战，让他们的友谊更加深厚，也让他们的意志更加坚定。在这场与外星异形的较量中，耶麻汰、阵内、凛林等人展现出了惊人的勇气和智慧。他们相互扶持，共同面对困难。虽然他们最终成功逃脱了异形的追杀，但他们的心中却留下了永远的伤痕。回到村落后，耶麻汰等人将这段经历告诉了首领。他们希望通过揭露这个阴谋，能够换来村落的安宁。然而，首领却对此守口如瓶，这让耶麻汰等人更加怀疑这个事件的真相。他们开始暗中调查，试图找出真相背后的秘密。随着调查的深入，耶麻汰等人发现了一个更加惊人的事实——这个火球事件并不是偶然发生的，而是有人故意为之。这个人的目的就是为了挑起忍者之间的矛盾，进而控制整个战国时期。为了揭露这个阴谋，耶麻汰等人决定勇敢地站出来。他们利用自己的智慧和勇气，成功地揭露了这个阴谋。原来，这个火球事件只是一个幌子，真正的目的是为了让忍者们自相残杀，从而更方便地控制他们。在揭露阴谋的过程中，耶麻汰等人经历了无数的困难和挑战。他们不仅要面对外星异形的威胁，还要应对来自其他势力的打压。但是，他们并没有放弃，而是坚定地走上了正义的道路。最终，耶麻汰等人成功地揭露了阴谋，拯救了整个伊贺村落。他们成为了村落的英雄，受到了人们的尊敬和赞誉。而那个神秘的火球事件，也成为了他们心中永远的回忆。